Questo corso ha lo scopo di introdurre i partecipanti alla bioinformatica, una area interdisciplinare che interseca la biologia e la genomica con le scienze dell’informazione, la statistica e la matematica per usare e costruire strumenti e metodi computazionali allo scopo di rispondere a domande fondamentali della biologia.

Programma del corso

Introduzione

Il Bio della Bioinformatica

Organizzazione e struttura di un genoma

Varianti genetiche

Trascrizione

Visualizzazione di un genoma: genome browsers

Generazione e struttura dei dati

Next generation sequencing: short reads

Next generation sequencing: long reads

Sequenze e allineamenti

Formato dei files

Dimensioni dei dati e disk footprint &  Requisiti computazionali delle -omiche

Analisi dei dati e caratteristiche datasets: trascrittomica

Trascrittomica: distribuzione dati e statistica

Trascrittomica: ambienti e software

Trascrittomica: metodi e dati intermedi 

Deep learning e trascrittomica

Prospettive